Приборная база и перечень услуг, предоставляемых Центром коллективного пользования ИБГ РАН

Биакор Х (Biacore X)

• Расчет кинетических констант взаимодействий молекул.
• Определение концентрации веществ в сильно разбавленных растворах.
• «Вылавливание» («fishing») веществ для дальнейшего анализа.

Конфокальный микроскоп Leica TCS SP2

• Измерение распределения интенсивности флуоресценции в фокальной плоскости и по объему исследуемых образцов при разных длинах волн в диапазоне длин волн возбуждения флуоресценции 450 – 663 нм (до семи независимых каналов регистрации одновременно).
• Получение трехмерных изображений флуоресцентно меченных препаратов с измерением геометрических параметров.
• Математическая обработка изображений (фильтрация, деконволюция/конволюция, контрастирование и т.п.).
• Анализ процессов методами FRET (флуоресцентного резонансного переноса энергии) и FRAP (восстановление флуоресценции после фотоотбеливания).
• Определение колокализации флуорофоров в образце.

Атомно-силовой микроскоп с контроллером Nanoscope III A

• Определение топографии поверхности образца с атомным разрешением ~10 нм по оси z и ~1 нм в плоскости xy (зависит от используемого зонда). Максимальная область сканирования 150х150 мкм в плоскости xy и 6 мкм по оси z. Изучаемая поверхность может контактировать как с воздухом, так и с жидкой фазой.
• Определение силы взаимодействия между зондом и образцом. При этом, возможна модификация зонда специфическими биомолекулами (например, антителами). Минимальная достоверно измеряемая сила взаимодействия 30 пН.

Мультифотонный микроскоп LSM 510 META NLO

• Анализ распределения и интенсивности флуоресценции в фокальной плоскости и по объему в биологических образцах (клетках и тканях) в диапазонах длин волн: - в конфокальном режиме – от 458 нм до 633 нм; в мультифотонном режиме – в соответствии с диапазоном ИК-лазера (710 – 990 нм).
• Определение характеристических времен затухания флуоресценции в изучаемом образце.
• Анализ изображений в режиме FLIM (fluorescence lifetime image microscopy=флуоресцентная микроскопия в реальном времени, дающая возможность определять характеристики затухания флуоресценции).
• Анализ методом FRAP.
• Определение колокализации флуоресцентных молекул, как по наложению «красок», так и по данным FRET (флуоресцентного резонансного переноса энергии).

Фосфоимиджер Cyclone Storage Phosphor Screen.
Определение распределения радиоактивного зонда в образцах, пришитых к нейлоновым и нитроцеллюлозным мембранам:

• Анализ полиморфных локусов в геноме.
• Количественное определение повторяющихся участков генома.
• Анализ уровня экспрессии генов.
• Характеристика длины и структуры транскриптов.
• Определение участков связывания для ДНК- и РНК-связывающих белков.

Система визуализации Image station 4000MM PRO

• Определение распределения различных зондов (флюоресцентные, люминесцентные и др. красители, радиоизотопные метки) в широком спектре образцов, включая гели, блоты, чашки, образцы волокон и пр.

Проточный цитофлуориметр–сортер Beckman Coulter EPICS ALTRA

• Определение жизнеспособности клеток.
• Определение содержания ДНК в клетке.
• Определение фагоцитарной активности.
• Определение внутриклеточных цитокинов.
• Анализ уровня экспрессии репортерных генов в клетках.
• Сортировка клеток по любым из вышеперечисленных параметров. Можно сортировать клетки в зависимости от их размера, гранулярности, уровня экспрессии тех или иных антигенов.

Zeta PALS

• Определение с помощью метода динамического светорассеяния гидродинамического радиуса наночастиц в пределах от 0,6 нм до 6 мкм.
• Определение дзета-потенциала наночастиц в пределах 6 мкВ до 100 мВ при рН от 1 до 13, при температуре от 6 оС до 100 оС и при электропроводности от 0 до 20 Си/м. Типичная длительность измерения – 30 с.

Прибор ПЦР в реальном времени CFX-96 (BioRad)

• Генотипирование организмов, идентификации аллелей (вариантов) генов.
• Геномная дактилоскопия (идентификация индивидуальных организмов, в частности для целей судмедэкспертизы).
• Обратная транскрипция (конвертация РНК в ДНК).
• Идентификация ДНК возбудителей заболеваний бактериальной и вирусной, паразитарной природы в пробе.
• Генотипирование вариантов генов (в частности анализ антибиотикоустойчивости микроорганизмов, анализ предрасположенности к заболеваниям).
• Анализ хромосомных нарушений (в частности при онкогенезе, в пренатальной диагностике, и др.).
• Анализ экспрессии генов.
• Установление титра возбудителей в пробе (количественная диагностика вирусов и др. инфекционных агентов в пробе).
• Определение генно-модифицированных организмов и содержания ГМО в пробах.
• Оптимизация условий проведения ПЦР для праймеров клиента.
• Анализ и обнаружение наличия мутаций (в т.ч. SNP).

Спектрофотометр ND-8000. Спектрофотометр позволяет проводить измерение до 8 образцов одновременно.

• Определение концентрации и чистоты нуклеиновых кислот.
• Количественный анализ протеинов, коньюгатов, метало-протеинов.
• Анализ белков методами Бредфорд, Лоури.
• Измерение плотности клеток в суспензии.
• Определение интенсивности флюоресценции при связывании метки с нуклеиновыми кислотами в биочипах.

Оборудование для трансфекции Nucleofector. Осуществление высокоэффективной доставки генетического материала в большое число различных по происхождению клеток:

• Получение стабильных клеточных линий-продуцентов целевых белков на основе линий клеток CHO-K1, SF+, Pichia methanolica.
• Изучение активностей регуляторных элементов генома в клеточных линиях человека, мыши, курицы, дрозофилы.
• Выключение экспрессии целевого гена при помощи siRNA.
• Модифицирование первичных культур клеток человека, мыши для направленного изменения свойств клеток.